福建醫科大學尚潔校區1
地址:福州市閩侯縣尚潔鎮學院路1號
2.福建醫科大學臺江校區
地址:福州交通路88號
學校有尚潔校區和臺江校區兩個校區，占地面積約1.500畝，學校建築面積42萬多平方米。主校區位於福州大學新區尚潔校區。有20個學院(系)，在校生21，000多人，教職工1，700人(含附屬醫院)，其中本部1，200多人。有五個直屬附屬醫院，其中第三附屬醫院正在建設中。秉承開放辦學的理念，與國內外30余所高校和科研院所開展了多層次、多角度的合作。
部門設置
截至2015年9月底，有研究生院、福建醫科大學基礎醫學院、福建醫科大學公共衛生學院、福建醫科大學醫學技術與工程學院、福建醫科大學藥學院、福建醫科大學護理學院、福建醫科大學口腔醫學院、福建醫科大學外國語學院、福建醫科大學人文學院。
設有協和醫學院、第壹臨床醫學院、第二臨床醫學院、省臨床醫學院、副總臨床醫學院、臨床教學部、思想政治理論教研室、體育教研室、海外教育學院、成人教育學院、繼續教育學院等20個學院(系)。