1949 11重慶解放，新中國接管國立重慶大學，後更名為重慶大學。1951年9月，為培養新中國石油工業急需的人才，與中央人民政府燃料工業部石油管理總局所屬西南石油工業學院(重慶科技學院前身)合作，招收石油工業專業學生。
1952-1956全國院系調整，重慶大學除工程學院部分專業外，其他院系拆分，參與組建華西醫科大學、四川大學、重慶建築大學、西南交通大學、西南政法大學、成都科技大學、北京郵電大學等多所知名高校。重慶大學附屬沙慈醫院獨立成立為重慶市腫瘤醫院。
從65438到0960，學校被確定為全國重點大學。1978後，學校大力恢復重建各學科，發展成為教育部直屬的全國重點綜合性大學。1981年11月，經國務院批準，重慶大學成為全國首批博士、碩士學位授予單位。1989年成為全國16重點工科大學科技工作研究會會員。
1996通過教育部“211工程”司預審，同年正式列入國家“211工程”和“九五”計劃，成為全國首批“211工程”。1999年入選首批全國大學生文化素質教育基地。