經濟研究所成立之初，就開始對天津的物價進行調查分析，編制了南開物價指數，在當時非常權威。此後，研究範圍逐漸擴大。如山東、河北兩省向東北移民，華北工業化，以及當時經濟發展中的諸多問題。他們就相關問題發表了許多有價值的研究報告，出版了《南開社會經濟季刊》英文版，並開始批量招收和培養研究生。
文革期間，南開大學經濟研究所的工作壹度被迫中斷，直到1973才在各實驗室恢復研究工作。粉碎"四人幫"後，南開經濟研究所的研究工作出現了新的局面。1979後，滕維藻、熊興美、顧樹堂教授等著名經濟學家相繼出任所長，研究領域進壹步拓寬，研究隊伍根據研究工作需要進行了調整和充實。研究生培養也全面恢復，南開經濟研究所獲得1984博士學位授予權。
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