EI主要是針對工程技術領域的學術論文發表，而SCI是綜合性的，任何專業都可以投稿和發表。SCI主要是學術期刊，EI有學術期刊和會議。有些作者反復投稿EI，但是中文提交SCI比較困難，所以SCI難度大很多。但是，這並不意味著EI很容易發布。有多少作者發表EI論文失敗？EI主要針對工程，作者要根據自己的實際情況選擇投稿。
總的來說，兩者都是國際知名和認可的。從發表的角度來說，肯定是SCI比較難。SCI比較全面，任何專業的論文都可以投稿。SCI本身投稿難度更大，評審周期更長，壹定程度上比EI更難發表。