中國農業科學院柑桔研究所成立於1960；中國農業科學院和西南農業大學於2001年9月成立；2005年7月，該所由中國農業科學院和西南大學(由原西南師範大學和西南農業大學合並而成)組建。在保留原中國農業科學院柑桔研究所名稱的同時，成立了西南大學柑桔研究所。[1]
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