國家海洋技術中心的主要職責是為我國海洋技術發展提供業務指導，為國家海洋自然資源管理、海洋公益服務和海洋安全提供技術支撐，開展我國海洋領域基礎性、前沿性和關鍵技術創新；主要業務方向包括國家全球海洋立體觀測網的規劃設計、國家海洋觀測網建設和運行的業務支撐、海洋空間規劃和功能區劃的研究編制等。