知網查重系統的工作原理是采用分層多級指紋結構。對於任何需要檢測的文檔，系統首先進行分層處理，按照章、段、句等層次創建指紋。，也采用同樣的技術為資源庫中的對比文檔創建指紋索引。這種分層的多層次指紋結構不僅能滿足長文檔的快速檢測，還能準確識別論文中的引用和抄襲。
知網的查重系統在防止學術不端行為方面發揮了重要作用，可以提高論文的質量和學術完整性，幫助用戶更好地修改和潤色論文。同時，知網的查重系統還提供相應的查重報告和修改建議，為用戶提供更全面、更專業的服務。