②原核生物mRNA的轉錄和翻譯壹般是偶聯的，而真核生物轉錄的mRNA前體需要經過轉錄後的加工，加工成成熟的mRNA，才能與蛋白質結合形成信息體開始工作。
③原核mRNA的半衰期很短，壹般幾分鐘，最長只有幾個小時(RNA噬菌體中的RNA除外)。真核生物的mRNA半衰期很長，比如胚胎中的mRNA可以達到幾天。
④原核和真核mRNA的結構特征也不同。
原核生物mRNA壹般在5’端有壹個非翻譯區，稱為前導序列，3’端有壹個非翻譯區，中間是蛋白質的編碼區，壹般編碼幾個蛋白質。真核mRNA(在細胞質中)壹般由5’-末端帽子結構、5’-末端非翻譯區、翻譯區(編碼區)、3’-末端非翻譯區和3’-末端多聚腺苷酸尾組成。除了m7G之外，該分子通常含有其他修飾的核苷酸，例如m6A。真核mRNA通常有相應的前體。DNA轉錄產生的原始轉錄產物可稱為原始前體(或mRNA前體)。壹般認為，原始前體在最終加工成成熟mRNA之前，必須經歷hnRNA中的異質RNA階段。